Skip to main content

Table 1 List of 74 isolates of Claviceps purpurea (Cp) and one each of C. pusilla, C. paspali and C. fusiformis

From: Simple sequence repeat markers that identify Claviceps species and strains

Sample

Host

Year

Cultivar

State

Cty

CA Group

C. purpurea, Cp01

L. perenne

2012

Pavilion

OR

Um

2

C. purpurea, Cp02

L. perenne

2012

Pavilion

OR

Um

3

C. purpurea, Cp03a

L. perenne

2012

Pavilion

OR

Um

3

C. purpurea, Cp04

L. perenne

2012

Provocative

OR

Um

2

C. purpurea, Cp05

L. perenne

2012

Provocative

OR

Um

2

C. purpurea, Cp06

L. perenne

2012

Top Hat II

OR

Um

4

C. purpurea, Cp07

L. perenne

2012

Top Hat II

OR

Um

3

C. purpurea, Cp08

L. perenne

2012

Pavilion

OR

Um

2

C. purpurea, Cp10

L. perenne

2012

Pavilion

OR

Um

3

C. purpurea, Cp11

L. perenne

2011

Esquire

OR

Um

3

C. purpurea, Cp12

L. perenne

2011

Esquire

OR

Um

3

C. purpurea, Cp13

L. perenne

2011

Esquire

OR

Um

3

C. purpurea, Cp14

P. pratensis

2012

Midnight

WA

Be

1

C. purpurea, Cp15

P. pratensis

2012

Midnight

WA

Be

1

C. purpurea, Cp16

P. pratensis

2012

Midnight

WA

Be

1

C. purpurea, Cp20

P. pratensis

2012

Seed screenings

WA

Be

1

C. purpurea, Cp21

P. pratensis

2012

Seed screenings

WA

Be

1

C. purpurea, Cp22

P. pratensis

2012

Arrowhead

WA

Be

1

C. purpurea, Cp23

P. pratensis

2012

Arrowhead

WA

Be

1

C. purpurea, Cp25b

S. cereale

2012

Wild

OR

Um

3

C. purpurea, Cp26a,b

L. perenne

2011

Seed screenings

OR

Um

3

C. purpurea, Cp27b

L. perenne

2011

Seed screenings

OR

Um

4

C. purpurea, Cp29b

L. perenne

2012

Esquire

OR

Um

4

C. purpurea, Cp30b

B. inermis

2011

Wild

WA

Wh

2

C. purpurea, Cp31b

B. inermis

2011

Wild

WA

Wh

2

C. purpurea, Cp32a,b

P. pratensis

2013

Seed screenings

OR

Un

1

C. purpurea, Cp33a,b

P. pratensis

2013

Baron

OR

Un

2

C. purpurea, Cp34

L. perenne

2013

Provocative

OR

Um

3

C. purpurea, Cp35

L. perenne

2013

Provocative

OR

Um

3

C. purpurea, Cp37

L. perenne

2013

Zoom

OR

Um

3

C. purpurea, Cp38

L. perenne

2013

Zoom

OR

Um

3

C. purpurea, Cp39

L. perenne

2013

Zoom

OR

Um

2

C. purpurea, Cp40

L. perenne

2014

 

OR

Um

4

C. purpurea, Cp41

L. perenne

2014

 

OR

Um

3

C. purpurea, Cp42

L. perenne

2014

 

OR

Um

3

C. purpurea, Cp43

L. perenne

2014

Casper

OR

Um

3

C. purpurea, Cp44

L. perenne

2014

Casper

OR

Um

4

C. purpurea, Cp45

L. perenne

2014

Casper

OR

Um

4

C. purpurea, Cp46

L. perenne

2014

Esquire

OR

Um

4

C. purpurea, Cp47

L. perenne

2014

Esquire

OR

Um

4

C. purpurea, Cp48

L. perenne

2014

Esquire

OR

Um

4

C. purpurea, Cp49

L. perenne

2014

Frontier

OR

Um

3

C. purpurea, Cp50

L. perenne

2014

Frontier

OR

Um

3

C. purpurea, Cp51

L. perenne

2014

Frontier

OR

Um

4

C. purpurea, Cp52

P. pratensis

2010

Seed screenings

OR

Je

2

C. purpurea, Cp53

P. pratensis

2010

Seed screenings

OR

Je

2

C. purpurea, Cp54

P. pratensis

2010

Seed screenings

OR

Je

2

C. purpurea, Cp55

L. perenne

2013

Esquire

OR

Be

4

C. purpurea, Cp56

L. perenne

2013

Esquire

OR

Be

3

C. purpurea, Cp57

L. perenne

2013

Esquire

OR

Be

4

C. purpurea, Cp58

L. perenne

2014

 

OR

Um

3

C. purpurea, Cp59

L. perenne

2014

 

OR

Um

4

C. purpurea, Cp61

L. perenne

2013

Zoom

OR

Um

3

C. purpurea, Cp62

L. perenne

2013

Zoom

OR

Um

3

C. purpurea, Cp63

L. perenne

2013

Zoom

OR

Um

3

C. purpurea, Cp64

L. perenne

2013

PST-2M20

OR

Be

4

C. purpurea, Cp65

P. pratensis

2012

Baron

OR

Un

2

C. purpurea, Cp66

L. perenne

2012

seed screenings

OR

Um

4

C. purpurea, Cp67

L. perenne

2012

seed screenings

OR

Um

4

C. purpurea, Cp69

L. perenne

2014

Pavillion

OR

Um

4

C. purpurea, Cp70

L. perenne

2014

Pavillion

OR

Um

3

C. purpurea, Cp71

L. perenne

2014

Pavillion

OR

Um

3

C. purpurea, Cp72

L. perenne

2013

Provocative

OR

Um

4

C. purpurea, Cp73

L. perenne

2013

Provocative

OR

Um

3

C. purpurea, Cp74

L. perenne

2013

Provocative

OR

Um

3

C. purpurea, Cp78

P. pratensis

2012

Baron

OR

Un

2

C. purpurea, Cp79

P. pratensis

2012

Baron

OR

Un

2

C. purpurea, Cp80

P. pratensis

2012

Baron

OR

Un

2

C. purpurea, 14-036-F

L. perenne

2013

Pavillion

OR

Um

4

C. purpurea, 14-037-F

L. perenne

2013

Pavillion

OR

Um

4

C. purpurea, 14-038-F

L. perenne

2013

Pavillion

OR

Um

4

C. purpurea, 14-039-F

L. perenne

2013

Pavillion

OR

Um

4

C. purpurea, 14-040-F

L. perenne

2013

Pavillion

OR

Um

4

C. purpurea, 14-041-F

L. perenne

2013

Pavillion

OR

Um

3

C. pusilla

      

C. paspali

      

C. fusiformis

      
  1. Host plant species, year of collection, name of host cultivar, state where collected, county (Cty) and cluster analysis (CA) Group are provided
  2. ST State where sample was collected, OR (Oregon), WA (Washington)
  3. Cty County where sample was collected, Be (Benton), Je (Jefferson), Um (Umatilla), Un (Union), and Wh (Whitman)
  4. aFour samples used for the first screening
  5. bEight samples used for the second screening